Dalam penelitian ini, seringkali dalam sebuah instansi atau lembaga dihadapi masalah yang terkait kedisiplinan yang bermula pada kemampuan kerja sehingga berakibat kepada kinerja pegawai. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh disiplin pegawai dan kemampuan kerja terhadap kinerja pegawai di Sekretariat Badan Karantina Pertanian Kementerian Pertanian. Jenis penelitian ini yaitu kuatitatif dimana pendekatan penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah pendekatan survei, sedangkan data dalam penelitian ini dikumpulkan melalui pengisian kuisioner. Data yang diperoleh dari responden akan di olah menggunakan bantuan aplikasi SPSS. Hasil penelitian ini adalah variabel disiplin kerja mempunyai pengaruh secara parsial terhadap variabel kinerja pegawai. Variabel kemampuan kerja mempunyai pengaruh secara parsial terhadap variabel kinerja pegawaia secara simultan mempunyai pengaruh terhadap variabel kinerja pegawai. Variabel disiplin kerja dan kemampuan kerja secara serempak mempunyai dampak positif terhadap kinerja pegawai.